無土栽培由于其從栽培設施到環境控制都能做到根據作物生長發育的需要進行監測和調控，因而具有一般傳統的土壤栽培所無法比擬的優越性，可以概括為以下面幾個方面。
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1、無土栽培的作物生長快，產量高，如番茄、黃瓜等作物的產量比土壤栽培高1倍以上。
2、免除土壤污染，可以生產出清潔衛生、少污染、無公害，品質好的產品。無土栽培的作物，特別是蔬菜、瓜果等，由于不施用人糞尿，廄肥等農家肥料，病蟲害相對又少，大大減少農藥的使用，不噴灑除草劑，因此其產品大大地減少了肥料、農藥、寄生蟲、病菌及重金屬等污染，清潔衛生無公害，同時，果大而整齊，顏色鮮艷，商品性和食用品質均好。
3、省工、節水、省肥。由于不需要進行土壤耕作、整地、施肥、中耕除草等，田間管理工作大大減少，不僅能節省用工，同時勞動強度亦不大，能大大改善農業生產的勞動條件，有利于省力化栽培。在人工控制下，通過營養液的科學管理來確保水分和養分的供應，因而可以大大減少了土壤栽培中水肥的滲漏、流失、揮發與蒸發，所以在沙漠干旱地區進行無土栽培亦是一項很好的“節水工程”。
4、可以避免土壤連作障害：如果土壤連作頻繁，會導致土傳病蟲害日見增長，土壤鹽類不斷積聚或土壤酸化、板結等障害，已成為影響蔬菜生產發展的一個重要制約因素，而應用無土栽培則可以避免上述土壤連作障害的發生。
5、不受地區、土壤等條件的限制。可以在屋頂、陽臺以及不能進行土壤栽培的地方如沙漠、油田、海涂和土壤嚴重污染的地區應用。